純化水一般是指生物制藥以及醫藥行業用純化水，水中的懸浮物、膠體、離子、有機物等雜質的去除率極高，幾乎除了水分子以外不含有其他離子或者化合物，能夠滿足醫藥生產過程對水質的嚴苛要求。醫用純化水可以用來清洗設備，用作制藥的原料，以及用作注射水用水制備的原料水。

純凈水一般是指食品行業用離子水，除去水中的膠體、懸浮物、離子、微生物等雜質，但仍有離子存在，在日常生活中我們飲用的純凈水、啤酒等都用的就是純凈水。

在生物制藥、醫藥行業，企業使用純化水設備必須嚴格按照2010版藥典規定的純化水指標進行工藝設計與安裝，并依照GMP認證相關要求進行驗證。而純凈水目前以GB17324-2003瓶（桶）裝飲用純凈水衛生標準。

一般來說，純化水對電導率的要求比純凈水的要高一些，但純凈水對pH值、細菌微生物的要求較高。在工藝也有所區別，純凈水設備常用工藝為單級反滲透（RO ) ，而用于制藥醫藥行業的純化水設備選擇工藝主要是雙級反滲透（RO + RO ) + 電去離子（EDI），工藝中的ED I技術主要是為了去除水中各種鹽份及雜質，才能滿足制藥醫藥行業的高品質用水需求。

無論是純化水還是純凈水，均是對人體無害的，兩者主要的區別是在用途上的差異。純化水主要應用于生物制藥、醫藥行業，而純凈水則用來飲用，當然了，在制水標準上也會有差異。

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