1、測定從原水入口、預處理各個環節反滲透給水、濃水以及反滲透產品水的細菌總數(TBC)，計算細菌變化數值。若發現濃水中的TBC明顯增加，說明反滲透膜上可能有粘泥形成。

2、給水中的有機物不僅自身可形成膜的污染，還可作為細菌滋生的營養物。所以可對有機物(以總有機碳表示，簡稱TOC)進行監測，膜廠家提示控制TOC2,KMnO4,H22O2、O3、紫外線照射等常規方法，控制重點是選取合適的殺菌劑，足夠長的接觸時間。對于氯類殺菌劑，投加量一般以進水余氯含量>1mg/L為準，根據不同的反滲透膜控制合適的殘余氯量。另外還可以采用氧化性和非氧化性殺菌劑(如Na2S2O5、NaHSO350mg/L，異噻唑啉酮15-25mg/L)定期、交替沖擊性、大劑量殺菌，可殺滅系統中大部分微生物，甚至可以穿透粘附于系統中的生物粘泥膜，起到殺滅、剝離作用。再就是嚴格控制給水中的有機物含量(以總有機碳TOC表示不超過2mg/L)，抑制細菌的生長繁殖。最好同時注意監測反滲透系統各環節的水中細菌總數(TBC)以便有效的預防，當發現有徽生物污染的癥狀時(壓差升高10%，產水量降低10%)應及時采取清洗措施(包括對預處理系統和RO系統的清洗)，以免污染加重。

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