ubuntu配置R語言環境

1. ubuntu進不去root，貌似是每次開機時默認root密碼都會產生一個新的。

   創新互聯公司是一家專注于成都做網站、成都網站建設與策劃設計,東興網站建設哪家好?創新互聯公司做網站,專注于網站建設10余年,網設計領域的專業建站公司;建站業務涵蓋:東興等地區。東興做網站價格咨詢:18982081108

  使用sudo passwrd重置root密碼

2. apt-get install r-base

3. apt-get  install  r-base-dev

4. 安裝成功。

5. 安裝Rstudio

下載安裝包安裝

下載 R-3.2.2.tar.gz

解壓：

1. tar 

   -zvxf 

   R-2.13.0.tar.gz 

    

配置：

1. cd 

   R-2.13.0 

    

2. ./configure 

   --prefix=/home/xxx/R 

   --enable-R-shlib 

    

    

prefix設置R的安裝路徑，enable-R-shlib可以保證lib目錄下的動態庫能夠共享

如果提示G77錯誤

1. sudo 

   apt-get 

   install 

   build-essential 

    

2. sudo 

   apt-get 

   install 

   gfortran 

    

如果提示錯誤：configure:error:--with-readline=yes(default)...

1. sudo 

   apt-get 

   install 

   libreadline6-dev 

    

如果提示錯誤：configure:error:--with-x=yes(default) and X11...

1. sudo 

   apt-get 

   install 

   libxt-dev 

    

安裝：

1. make 

    

2. make 

   install 

    

link到bin目錄下：

1. cd 

   /bin 

    

2. sudo 

   ln 

   -sv 

   /home/xxx/R/bin/R 

    

至此安裝完畢。

------------------------------------------------------

安裝pkg：

終端下輸入：R

1. source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R") 

    

2. biocLite() 

    

默認將安裝一下幾個包

affy affydata affyPLM

annaffy annotate Biobase

Biostrings DynDoc gcrma

genefilter geneplotter hgu95av2

limma marray matchprobes

multtest ROC vsn

xtable affyQCReport

如果需要Bioconductor上別的包的話，可以使用

biocLite(c("pkg1", "pkg2"))

如：

1. biocLite(c("copula", 

   "pspline")) 

    

安裝CRAN上的包

1. install.packages(c("pkg1", 

   "pkg2")) 

    

來安裝（pkg1和pkg2為需要安裝的包）。
------------------------------------------------------

編輯器：

1.直接shell。終端輸入R，就進入R命令行了。

2.安裝GUI：Rcmdr

1. sudo 

   apt-get 

   install 

   r-cran-rodbc 

    

2. sudo 

   apt-get 

   install 

   r-cran-rcmdr 

    

運行R后，library(Rcmdr)就可以打開圖形界面。

本文名稱：ubuntu配置R語言環境
轉載來于：http://m.kartarina.com/article0/geseio.html

成都網站建設公司_創新互聯，為您提供做網站、虛擬主機、商城網站、用戶體驗、標簽優化、動態網站

廣告

聲明：本網站發布的內容（圖片、視頻和文字）以用戶投稿、用戶轉載內容為主，如果涉及侵權請盡快告知，我們將會在第一時間刪除。文章觀點不代表本網站立場，如需處理請聯系客服。電話：028-86922220；郵箱：631063699@qq.com。內容未經允許不得轉載，或轉載時需注明來源： 創新互聯